而此时，一意主和的明辽东经略：宋应昌，却发觉倭方尚未准备好幕府关白：丰臣秀吉，的投降书？
于是明辽东经略就命明御倭游击将军：沈惟敬，第四次复入倭营促谢表，明御倭游击将军于同年12月初7日，再入幕府第一军左副将：小西行长，的军营中展开和谈。
明万历二十二年公元1594年正月初3日，幕府第一军左副将：小西行长、幕府：小西飞与明御倭游击将军：沈惟敬，等人终于伪造了一封幕府关白：丰臣秀吉，的《关白降表》。
不过当时关于幕府关白提出的议和条件书，却没有报告给大明朝廷，仅仅只是围绕在大明内部群臣们商议要不要与幕府议和之事？而展开了激烈的争论。
正月20日，明神宗：朱翊钧，下诏说道“去年各大布政司灾伤，以；山东承宣布政使司、河南承宣布政使司，以及南直隶徐州、淮安府，等处尤为严重！朕屡次下令救济，不知有司是曾否奉行？百姓是否得到实惠？值此公私交困之时，不知各地除了动用国库钱粮之外，是否有急救便宜措施？各地闹事的矿徒是否已经安置归农？今日四方吏治，全不讲求荒政，牧养小民，惟以搏击风力为名声，交际趋承为职业，费用侈于公庭，追呼偏于闾里，嚣论者不能禁止，流亡者不能招徕，遇有盗贼，则互相隐匿，或故意徇私，以求免地方失事之咎，而各地巡抚、巡按官亦止知请振请蠲，不能汰一苛吏，革一弊法，如此上下相蒙，酿成盗贼之患，朕甚忧之，自今当以安民弭盗为有司之黜陟，如有仍前欺隐及玩视诏令者，当重治不宥。”
2月12日，明吏部文选清吏司郎中：顾宪成，先因反对三皇子并封王之事而触犯了明神宗，后又在一年一度的「京察」中因支持明吏部尚书：孙珑，而得罪了明内阁首辅：王锡爵。
恰逢王阁老致仕（辞官）群臣们开始会推阁臣，先前由明吏部文选清吏司郎中：顾宪成，推举明东阁大学士：王家屏，明神宗弃而不用。
他又举荐了明吏部尚书：孙珑、明刑部尚书：孙丕扬，被明神宗发怒而革去其职。
待顾宪成回到故里南直隶常州府无锡县，与弟弟顾允成共同倡议重修东林书院，之后并与明揭阳县典史：高攀龙、明都察院福建道监察御史兼广西巡按：钱一本、明光州学正：薛敷教、明太仆寺少卿：史孟麟、明安吉州判官：于孔兼，诸人一起讲学其中，每岁一大会，每月一小会。
时士大夫怀志而为当局罢斥者，多闻风响附，学舍至不能容，讲学之余，往往讽议时政裁量人物，朝内的官员亦遥相应和，由是东林之名大著。
人称顾宪成等辞官大臣为「东林党」其后，明刑部尚书：孙丕扬、明南直隶吏部员外郎：邹元标、明吏部考功清吏司郎中：赵南星，等人也相继到此讲学，自负气节，愿与朝廷相抗，是为东林党之议开始。
而浙江承宣布政使司宁波府鄞县人士，明詹事府少詹事兼翰林院侍读学士：沈一贯，以善于奉承因此得明神宗欢心，遂入内阁，成为浙江承宣布政使司派系官僚首领，人称为〈浙党〉。
东林党人以讲学联络人士，浙党人恃权求胜，从此东林党、浙党，之间互相争斗长达五十年。
5月28日南直隶凤阳行都督府颍州百姓：王自简，聚众千人发动造反，旋即遭到官军镇压。
6月20日，朝廷以明颍州兵备道副使：李骥，等俘获王自简等人有功，下令嘉奖，并各赏银有差。
10月23日，与明蓟辽总督：顾养谦，一起力主对幕府议和封贡的明兵部尚书：石星，再次上疏请尽快封贡幕府，并说道“当初幕府倭军攻占李氏朝鲜王国，是利用其威，及其退还王京、送回王子和陪臣，是讲食用，陛下慨然许封，则当尽快封之，一封而倭寇以退，李氏朝鲜王国以保，外患以息，内备以修，今倭军久住釜山浦，我朝之欲封不封，既已失信！彼之请封未封，必复生疑，故封后而勒令尽归，宜无不得，封前而数为责备，似难必行，宜一面令倭使：小西飞，进京确示予封之信，一面令侵朝倭军统帅：小西行长，即退以待册使往之，即使小西行长不敢速归，待册使至而返，亦无不可，封则李氏朝鲜王国暂安，得自为战守，若复设难成之约，则祸及李氏朝鲜王国，全罗左右道必失，我辽东都指挥使司亦难以支持，若封后有反复，臣愿自往莅，事不济则治臣罪。”